23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1439 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  880    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  67.44 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  34.64 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  35.34 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  33.9 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  33.83 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  29.07 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  31.7 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  30.23 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  30.28 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  28 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  31.13 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  28.48 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  39.9 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  25.1 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  37.74 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  32.76 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  28.91 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  27.31 
 
 		 497 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  23.32 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  27.86 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  30.65 
 
 		 646 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>