24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0990 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  100 
 
 		 470 aa  906    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  50.11 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  38.09 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  30.55 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  31.78 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  32.91 
 
 		 481 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  31.66 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  31.34 
 
 		 462 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  29.83 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  29.57 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  45.45 
 
 		 489 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  30.23 
 
 		 472 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  29.75 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  29.7 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  24.55 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  32.61 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  27.86 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  24.94 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  25.11 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  29.66 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  33.86 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  25.15 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  26.05 
 
 		 528 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>