24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8475 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  100 
 
 		 498 aa  922    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  27.35 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  27 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  46.79 
 
 		 468 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  43.55 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  46.67 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  38.39 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  40.15 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  40.43 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  33.51 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  34.18 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  38.14 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  36.89 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  35.04 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  42.45 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  27.6 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  32.12 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  31.86 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  26.98 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  32.59 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  33.65 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  30.08 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1446  hypothetical protein  34.4 
 
 		 447 aa  47  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>