24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5455 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
473 aa  908    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  29.32 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  29.18 
 
 
479 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  27.45 
 
 
528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  29.25 
 
 
509 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  29.36 
 
 
487 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0082  hypothetical protein  29.36 
 
 
487 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201998  decreased coverage  0.00368698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  30 
 
 
486 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  27.07 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  25 
 
 
503 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  25 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  24 
 
 
515 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  25.8 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  33.09 
 
 
465 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  27.64 
 
 
464 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5780  hypothetical protein  25.15 
 
 
505 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00948256  normal  0.178087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  39.05 
 
 
497 aa  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  34.43 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  31.15 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  28.22 
 
 
467 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  29.73 
 
 
468 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  30.89 
 
 
441 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  33.07 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  32.04 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>