29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0608 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  100 
 
 
468 aa  887    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  44.13 
 
 
481 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  36.34 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  32.21 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  32.99 
 
 
465 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  30.8 
 
 
470 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  34.33 
 
 
462 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  35.12 
 
 
472 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  32.48 
 
 
464 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  31.26 
 
 
465 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  35.08 
 
 
467 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  36.13 
 
 
472 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  32.61 
 
 
484 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  30.38 
 
 
464 aa  133  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  44.56 
 
 
489 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  29.87 
 
 
492 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  46.79 
 
 
498 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  42.86 
 
 
468 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  26 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  30.61 
 
 
646 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  31.86 
 
 
450 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  35 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  27.45 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  25.85 
 
 
528 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  32.79 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  30.63 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  36.56 
 
 
467 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  31.13 
 
 
473 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  32.54 
 
 
485 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.50616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>