25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3148 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  100 
 
 		 484 aa  919    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  32.26 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  32.04 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  31.22 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  32.17 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  28.51 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  31.14 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  27.37 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  28.98 
 
 		 462 aa  93.6  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  38.83 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  38.81 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  26.21 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  38.81 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  31.59 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  36.89 
 
 		 498 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  31.09 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  25.39 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  32.42 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  33.85 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  37.37 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  34.68 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  30.91 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  26.92 
 
 		 489 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  33.08 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  27.81 
 
 		 485 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>