More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1967 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1967  helicase-like  100 
 
 		 932 aa  1915    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519708  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0710  helicase domain protein  40.71 
 
 		 778 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0811  helicase domain-containing protein  40.53 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0754  helicase domain protein  38.7 
 
 		 714 aa  373  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0938  helicase domain-containing protein  39.93 
 
 		 789 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4414  helicase domain-containing protein  40.54 
 
 		 714 aa  350  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2996  helicase domain-containing protein  39.06 
 
 		 757 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0436  helicase domain protein  35.92 
 
 		 815 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2066  helicase domain-containing protein  46.1 
 
 		 585 aa  280  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2359  helicase domain-containing protein  45.76 
 
 		 585 aa  279  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31704  mitochondrial RNA helicase  36.2 
 
 		 640 aa  269  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36409  predicted protein  33.91 
 
 		 471 aa  251  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.306312  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04723  mitochondrial ATP-dependent RNA helicase Suv3, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10820)  31.99 
 
 		 832 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0229389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10251  predicted protein  43.77 
 
 		 306 aa  214  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0349969  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06190  RNA helicase like protein, putative  40.83 
 
 		 828 aa  197  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2285  helicase domain protein  38.21 
 
 		 550 aa  149  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1698  helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 997 aa  148  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1828  helicase domain-containing protein  35.56 
 
 		 975 aa  147  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232638  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0074  helicase domain-containing protein  33.92 
 
 		 1142 aa  144  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313294  normal  0.416773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4118  helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 851 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0253  helicase domain protein  36.05 
 
 		 890 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0573  helicase-like  35.51 
 
 		 984 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.013088  hitchhiker  0.00000121316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1721  helicase domain protein  34.49 
 
 		 1135 aa  141  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0783  helicase domain protein  33.83 
 
 		 987 aa  140  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000205991  normal  0.0820229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1131  helicase domain-containing protein  33.83 
 
 		 1027 aa  140  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0074  helicase-like  32.56 
 
 		 1066 aa  140  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3311  helicase-like  34.23 
 
 		 978 aa  140  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505804  normal  0.0528841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3248  helicase domain protein  35 
 
 		 1139 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.916633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2739  helicase-like protein  33.44 
 
 		 920 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0492  helicase domain protein  34.98 
 
 		 1093 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3115  helicase domain-containing protein  33.08 
 
 		 1026 aa  138  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3088  helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 837 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7546  putative ATP-dependent RNA and DNA helicase  34.57 
 
 		 1177 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2292  helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 925 aa  137  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.94626  normal  0.593111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2639  helicase domain-containing protein  34.55 
 
 		 1101 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4347  ATP-dependent helicase  33.84 
 
 		 1047 aa  136  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755222  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1705  photosynthesis protein modulator  33.85 
 
 		 1003 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000107497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0281  helicase-like  35.48 
 
 		 1119 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.288418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4802  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1154 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.782354  decreased coverage  0.000173761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0545  helicase-like  34.22 
 
 		 1169 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0548  helicase  36.12 
 
 		 1145 aa  135  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0504  helicase-like  34.22 
 
 		 1140 aa  134  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.68867  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0409  helicase  34.28 
 
 		 1124 aa  134  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0121  helicase-like  32.97 
 
 		 855 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4857  helicase domain protein  33.93 
 
 		 1136 aa  132  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526105  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  34.06 
 
 		 1140 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3376  helicase-like  31.95 
 
 		 1037 aa  131  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3817  helicase domain protein  32.45 
 
 		 1087 aa  131  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4146  helicase domain protein  31.95 
 
 		 1082 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139556  normal  0.136367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4904  helicase domain protein  34.04 
 
 		 1138 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.891527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5700  helicase domain protein  32.71 
 
 		 793 aa  131  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.660496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3540  helicase domain-containing protein  32.63 
 
 		 865 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420075  normal  0.672772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2422  putative ATP-dependent helicase, MgpS  34.13 
 
 		 930 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3705  helicase domain-containing protein  32.08 
 
 		 1081 aa  110  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.402139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 837 aa  106  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  28.75 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.48 
 
 		 848 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.75 
 
 		 861 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.75 
 
 		 861 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28 
 
 		 835 aa  99  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 832 aa  98.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.75 
 
 		 851 aa  98.2  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.27 
 
 		 873 aa  97.8  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.3 
 
 		 852 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.3 
 
 		 852 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 868 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.93 
 
 		 837 aa  96.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.3 
 
 		 852 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.99 
 
 		 847 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.02 
 
 		 827 aa  96.3  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  27.9 
 
 		 891 aa  95.5  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  26.3 
 
 		 853 aa  95.5  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1231 aa  94.4  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  27.59 
 
 		 877 aa  94.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.55 
 
 		 861 aa  94  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  26.33 
 
 		 860 aa  93.2  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.23 
 
 		 838 aa  92.8  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  26.4 
 
 		 842 aa  92  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.33 
 
 		 710 aa  92.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  25.62 
 
 		 842 aa  92.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.7 
 
 		 832 aa  92  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 		 847 aa  91.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 836 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.02 
 
 		 869 aa  90.5  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.65 
 
 		 831 aa  90.5  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  26.48 
 
 		 830 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  26.32 
 
 		 855 aa  89.7  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  27.44 
 
 		 885 aa  90.1  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  27.91 
 
 		 869 aa  89  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  26.17 
 
 		 885 aa  87.8  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.93 
 
 		 870 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.33 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.86 
 
 		 950 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 		 894 aa  85.9  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.84 
 
 		 865 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.71 
 
 		 866 aa  85.1  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  40.95 
 
 		 1185 aa  82  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.31 
 
 		 856 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1086  helicase domain-containing protein  44.44 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.82 
 
 		 876 aa  76.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>