41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1788 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  731    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  42.28 
 
 
388 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  39.04 
 
 
387 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  35.64 
 
 
383 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  32.74 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  31.71 
 
 
386 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  29.17 
 
 
415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  29.76 
 
 
419 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  28 
 
 
419 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  27.5 
 
 
414 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  28.92 
 
 
415 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  28.92 
 
 
415 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  28.92 
 
 
415 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  29.14 
 
 
415 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  29.88 
 
 
415 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  29 
 
 
415 aa  122  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  27.84 
 
 
448 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  28.89 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  28.89 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  28.89 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  26.96 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  27 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  28.08 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  27.53 
 
 
412 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  28.08 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  28.18 
 
 
387 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  28.53 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  28.29 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  28.17 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  26.65 
 
 
417 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  29.27 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  25.99 
 
 
415 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  27.39 
 
 
430 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  24.52 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  25.85 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  26.02 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  27.37 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  22.76 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  25.7 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  24.24 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  23.2 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>