90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1181 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
394 aa  822    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  72.47 
 
 
401 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  72.22 
 
 
404 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  70.38 
 
 
401 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  69.77 
 
 
403 aa  588  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  69.87 
 
 
401 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  70.13 
 
 
401 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  67.84 
 
 
405 aa  570  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  66.75 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  66.41 
 
 
403 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  65.64 
 
 
399 aa  551  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  64.87 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  63.08 
 
 
401 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  63.54 
 
 
396 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  60.2 
 
 
398 aa  521  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  61.11 
 
 
396 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  61.52 
 
 
395 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  60.76 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  61.42 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  59.45 
 
 
401 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  58.78 
 
 
392 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  58.97 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  57.29 
 
 
402 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  58.91 
 
 
398 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  58.88 
 
 
400 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  57.72 
 
 
401 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  57.44 
 
 
397 aa  486  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  58.91 
 
 
398 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  58.42 
 
 
403 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  56.6 
 
 
399 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  58.91 
 
 
397 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  57.58 
 
 
409 aa  478  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  58.57 
 
 
405 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  56.6 
 
 
400 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  59.43 
 
 
399 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  57.51 
 
 
405 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  57.62 
 
 
398 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  59.69 
 
 
398 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  58.23 
 
 
403 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  58.66 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  44.8 
 
 
417 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.31 
 
 
405 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.17 
 
 
414 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  44.28 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  44.55 
 
 
414 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 
414 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 
414 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  41.04 
 
 
412 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  42.04 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  40.84 
 
 
413 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  40.55 
 
 
413 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  40.3 
 
 
413 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  40.62 
 
 
399 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  40.36 
 
 
399 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 
426 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  40.05 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  39.8 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  39.8 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  39.3 
 
 
413 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  39.04 
 
 
407 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 
422 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  38.24 
 
 
424 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  37.99 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  29.15 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  29.5 
 
 
403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.39 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 
407 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  28.75 
 
 
407 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  28.75 
 
 
407 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  29.8 
 
 
401 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.49 
 
 
398 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.49 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  20.94 
 
 
748 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  23.83 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  23.83 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.83 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  23.83 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.83 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  21.72 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  21.21 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.66 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23.1 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.74 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  22.41 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2977  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.28 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  20.9 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.64 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.82 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>