More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0781 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  100 
 
 		 362 aa  738    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  39.67 
 
 		 369 aa  275  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  37.29 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  37.91 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  37.36 
 
 		 364 aa  235  8e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0279  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.34 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1205  competence/damage-inducible domain-containing protein  32.04 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1081  competence/damage-inducible domain-containing protein  32.04 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0661  competence/damage-inducible domain-containing protein  32.32 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1162  competence/damage-inducible protein, CinA family  31.49 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  49.31 
 
 		 162 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  47.89 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  48.95 
 
 		 184 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  47.95 
 
 		 162 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  47.95 
 
 		 162 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  46.53 
 
 		 172 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  45.86 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  44.14 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  41.83 
 
 		 179 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  44.14 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  48.46 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  45.99 
 
 		 206 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  41.94 
 
 		 166 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.36 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  45.59 
 
 		 168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  43.97 
 
 		 166 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  40 
 
 		 218 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  41.57 
 
 		 178 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  48.98 
 
 		 164 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  45.64 
 
 		 162 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  44.08 
 
 		 159 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  44.68 
 
 		 165 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 165 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  45.26 
 
 		 208 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  43.8 
 
 		 203 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  45.26 
 
 		 211 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  43.97 
 
 		 165 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  43.97 
 
 		 165 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  43.97 
 
 		 165 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  45.26 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  43.48 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  45.95 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  43.26 
 
 		 165 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  47.89 
 
 		 160 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  44.44 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  42.03 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  42.03 
 
 		 421 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  46.67 
 
 		 168 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  42.03 
 
 		 421 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  41.38 
 
 		 166 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  38.67 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  41.29 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  42.18 
 
 		 168 aa  115  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  41.38 
 
 		 175 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  43.54 
 
 		 162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  46.92 
 
 		 165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  32.53 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.73 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  44.52 
 
 		 168 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.84 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  41.26 
 
 		 164 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  41.18 
 
 		 163 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.82 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  43.07 
 
 		 208 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  39.24 
 
 		 160 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  41.84 
 
 		 208 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  41.78 
 
 		 166 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  42.76 
 
 		 162 aa  112  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  38.61 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  40.6 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  40.13 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  41.33 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.26 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  42.5 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  34.15 
 
 		 175 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.95 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  43.71 
 
 		 200 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  41.38 
 
 		 159 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  44.93 
 
 		 166 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  38.61 
 
 		 160 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  42.07 
 
 		 175 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  50.86 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  41.84 
 
 		 165 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  41.84 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  39.31 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  41.13 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  36.65 
 
 		 166 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>