More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3884 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3884  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 262 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4275  phosphomethylpyrimidine kinase  86.21 
 
 		 261 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.096784  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.06 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 286 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  45.96 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1932  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  40.23 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.9 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  49.79 
 
 		 449 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  39.69 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  40.45 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  45.79 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.46 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 		 436 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  41.2 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  39.1 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3401  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>