102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1405 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  86.59 
 
 
261 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  56.59 
 
 
262 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  55.39 
 
 
272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  51.49 
 
 
267 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  56.12 
 
 
299 aa  235  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  50.38 
 
 
270 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  52.14 
 
 
281 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  49.33 
 
 
315 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  40.77 
 
 
264 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  41.15 
 
 
264 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  47.51 
 
 
265 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  36.1 
 
 
271 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  40.77 
 
 
261 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  41.38 
 
 
304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  44.62 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  37.98 
 
 
266 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  36.64 
 
 
274 aa  166  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  40.78 
 
 
282 aa  165  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  37.21 
 
 
268 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  37.98 
 
 
259 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  40.31 
 
 
267 aa  158  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  34.36 
 
 
280 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  35.29 
 
 
268 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  39.53 
 
 
262 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  36.19 
 
 
269 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  38.75 
 
 
262 aa  152  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  41.89 
 
 
289 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  38.81 
 
 
278 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  39.53 
 
 
252 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  38.76 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
1827 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  37.45 
 
 
261 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  39.45 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  38.13 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  37.31 
 
 
263 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  36.92 
 
 
277 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  37.59 
 
 
269 aa  141  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  32.57 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  30.12 
 
 
278 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  35.9 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  39.84 
 
 
258 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  33.33 
 
 
244 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  40.08 
 
 
262 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  42.15 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  37.09 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  37 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  40.77 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  34.5 
 
 
298 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  37.64 
 
 
263 aa  133  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  41.92 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  38.64 
 
 
258 aa  132  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  37.26 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  39.22 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  34.6 
 
 
277 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  34.24 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  37.5 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  33.83 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  35.21 
 
 
300 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  37.63 
 
 
278 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  35.21 
 
 
300 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  33.08 
 
 
274 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  31.77 
 
 
282 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  42.97 
 
 
256 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  41.91 
 
 
263 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  35.5 
 
 
300 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  35.11 
 
 
300 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  35.11 
 
 
300 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  32.8 
 
 
266 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0862  protein of unknown function DUF62  37.15 
 
 
293 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  37.11 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  36.53 
 
 
283 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  30.5 
 
 
267 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  32.18 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  30.42 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  32.1 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  38.13 
 
 
242 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  32.85 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  35.32 
 
 
272 aa  109  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  31.34 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  31.34 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  30.29 
 
 
299 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  35.58 
 
 
292 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  31.32 
 
 
244 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1812  hypothetical protein  36.15 
 
 
252 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  35.8 
 
 
239 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  34.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  34.62 
 
 
359 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  30.8 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  34.29 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  28.46 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  30.47 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  37.4 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  25.67 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  28.96 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  24.06 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>