69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3735 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  51.34 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  50.89 
 
 		 232 aa  225  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  50.89 
 
 		 232 aa  225  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  52.61 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  52.13 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  52.13 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  52.13 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  51.66 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  42.66 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.58 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.12 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  41.74 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.02 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  34.27 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.8 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.11 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.6 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  31.89 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  27.35 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  27.4 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  26.32 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  28.41 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  21.76 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0312  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.4 
 
 		 350 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.35 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.851339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0277  transcriptional activator FtrB  27.14 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0301  transcriptional activator FtrB  27.14 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  25.24 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.19 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  23.83 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.38 
 
 		 228 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1785  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.63 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0968  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72963  normal  0.699928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>