More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3593 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  465  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.43 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.17 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.75 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  25.11 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  24.03 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.97 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 263 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.96 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  24.24 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  24.36 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0931  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  23.9 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  26.22 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  23.79 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  23.08 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>