More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0931 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0931  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  497  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475471  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4253  transcriptional regulator, GntR family  69.92 
 
 
237 aa  350  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4062  transcriptional regulator, GntR family  69.49 
 
 
237 aa  348  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0193  transcriptional regulator, GntR family  63.49 
 
 
242 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.852438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0978  transcriptional regulator, GntR family  53.19 
 
 
237 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.02 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  32 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  32 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.65 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.65 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  30.26 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
252 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
252 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
252 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  28.92 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  25.37 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  28.1 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.8 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.86 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>