190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3009 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  35 
 
 
326 aa  84.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4281  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  34.88 
 
 
134 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  34.04 
 
 
326 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  33.85 
 
 
332 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.65 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  32.69 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30 
 
 
331 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  38.52 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  29.77 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  35.64 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  30.77 
 
 
329 aa  67  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  36.54 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  31.54 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  36.54 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  31.06 
 
 
336 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  32.06 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  35.92 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  28.3 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  34.95 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  35 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  31.06 
 
 
330 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  34.95 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0529  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467487  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4186  putative sugar transport PTS system IIA component  34.29 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  34.29 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0260  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  34.29 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  36.89 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  32.12 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3429  PTS system fructose subfamily IIA component  31.01 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  32.04 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.36 
 
 
329 aa  60.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.22 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  32.04 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  32.11 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  29.2 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  30.15 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  33.02 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  29.79 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  33.02 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  33.02 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  33.02 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  33.02 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  33.02 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  32.37 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  33.02 
 
 
219 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  32.08 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.82 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  32.38 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1665  PTS system fructose subfamily IIA component  29.46 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  26.42 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  32.41 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.68 
 
 
324 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  31.73 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.68 
 
 
324 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  28.68 
 
 
324 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1204  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  34.67 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  28.68 
 
 
320 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.19 
 
 
323 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  26.77 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  26.24 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.68 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.13 
 
 
322 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  30.97 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  30.1 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  31.43 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  31.07 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  32.11 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.37 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  32.69 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.37 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>