More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1137 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 
587 aa  734    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1137  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
597 aa  1220    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000518109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
594 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
591 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
591 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
591 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
591 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
591 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
591 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
589 aa  600  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
585 aa  595  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
600 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
593 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
591 aa  591  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
587 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
593 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
594 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
613 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
590 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
593 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
588 aa  569  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
598 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
597 aa  569  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
589 aa  568  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
587 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
582 aa  565  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
588 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
592 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
594 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
586 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
595 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
588 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
626 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
582 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
595 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
608 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
597 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
606 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
590 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
583 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1620  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
581 aa  558  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
614 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
594 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
595 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
582 aa  558  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
618 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
603 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
590 aa  552  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
599 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
614 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
576 aa  549  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
610 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
592 aa  545  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
617 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
597 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
598 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
600 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18201  aspartyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
606 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
588 aa  545  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
602 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
589 aa  541  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
581 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
597 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
597 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  47 
 
 
601 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
599 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
582 aa  541  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
623 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
623 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
588 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
598 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
601 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
598 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
598 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
598 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
594 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
590 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
590 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29551  aspartyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
606 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
594 aa  535  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>