67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2658 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  639    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2563  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2314  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
288 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.856278  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  37.56 
 
 
271 aa  136  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  26.87 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0768  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  29.05 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  29.37 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  24.7 
 
 
385 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  33.86 
 
 
150 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  28.4 
 
 
194 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  33.63 
 
 
172 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  25.4 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
667 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
748 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  21.05 
 
 
1084 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
666 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 
667 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  33.65 
 
 
242 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  28.35 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
668 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 
565 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 
670 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2692  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.9 
 
 
768 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.57 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  24.86 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  34.29 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  29.5 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 
566 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  23.33 
 
 
1182 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 
583 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.71 
 
 
572 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  35.85 
 
 
177 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  21.53 
 
 
694 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 
566 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  27.18 
 
 
744 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  24.8 
 
 
660 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  21.59 
 
 
1012 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.63 
 
 
1474 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.52 
 
 
650 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 
566 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 
1917 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  24.8 
 
 
660 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  23.08 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
564 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
1816 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1408  paREP7  26.19 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25 
 
 
658 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  31.01 
 
 
173 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.15 
 
 
552 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 
1079 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1678  pseudouridine synthase, Rsu  25.81 
 
 
649 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151173  normal  0.0771799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  22.1 
 
 
1263 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  23.37 
 
 
1104 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.292314  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  23.53 
 
 
1285 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.295891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.01 
 
 
1475 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  28.22 
 
 
1027 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1311  hypothetical protein  18.85 
 
 
697 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00222166  hitchhiker  0.000000478803 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0602  putative purine NTPase  26.32 
 
 
226 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  23.55 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2182  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.7 
 
 
682 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000159481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6518  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.2 
 
 
514 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.79 
 
 
1644 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.86 
 
 
1954 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.5 
 
 
662 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>