142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2189 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  276  8e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  59.74 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  37.5 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 831 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 		 781 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  51.06 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  54.76 
 
 		 861 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 778 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  43.4 
 
 		 823 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 794 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  45.61 
 
 		 804 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 908 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 811 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 787 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  37.31 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 806 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 809 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 801 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 		 837 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 816 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 765 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  52.38 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 787 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  52.5 
 
 		 973 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 799 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 772 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 776 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 777 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  55.56 
 
 		 467 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 		 782 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 807 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 842 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 842 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 842 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 842 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 842 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 788 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 818 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  33.8 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  33.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  54.55 
 
 		 47 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 798 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  50 
 
 		 55 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 796 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  45.45 
 
 		 805 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  34.43 
 
 		 821 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 773 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  54.55 
 
 		 48 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 810 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  28.57 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 826 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  29.85 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  53.33 
 
 		 467 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  52.27 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1472  SelT/selW/selH selenoprotein  37.5 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.470177  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  45.24 
 
 		 807 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 796 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 826 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  34.25 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3775  ABC transporter related  42.55 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  53.33 
 
 		 466 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 1020 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  29.11 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 809 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 		 835 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  29.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 786 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  37.74 
 
 		 767 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  51.16 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 793 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 792 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  31.51 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 831 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 833 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 795 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  46.51 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 895 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 787 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 786 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 868 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  45.24 
 
 		 295 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  34.92 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 786 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  45.24 
 
 		 928 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  46.51 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 786 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  50 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 783 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 841 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0239  Zinc finger, MYM-type  52.27 
 
 		 45 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4513  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 846 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 801 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  29.85 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1817  putative selenoprotein  34.78 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.702891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1398  hypothetical protein  30.26 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0987183  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  28.57 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  47.73 
 
 		 48 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  29.73 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  47.83 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>