39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0571 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  100 
 
 		 79 aa  159  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  59.74 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  31.58 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  42.86 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  39.44 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  36.99 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  36.23 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  36.62 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4077  hypothetical protein  35.53 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258277  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  27.03 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1792  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32780  SelT/selW/selH selenoprotein  35.21 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3449  conserved hypothetical selenoprotein  43.14 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1983  conserved hypothetical selenoprotein  34.72 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  35.21 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  33.78 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3596  selenoprotein W-related  40 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.780688  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20880  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  33.8 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1817  putative selenoprotein  39.71 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.702891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4513  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  43.4 
 
 		 76 aa  43.5  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4019  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456234 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2408  conserved hypothetical selenoprotein  36.67 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.72928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1798  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  39.44 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2021  putative selenoprotein  37.14 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  32.39 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4026  hypothetical protein  43.4 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  34.67 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  32.5 
 
 		 104 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2298  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.928945  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.652713  normal  0.0967165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1342  putative selenoprotein  38.16 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0645391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  32.39 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  34.38 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1037  hypothetical protein  37.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2959  hypothetical protein  29.33 
 
 		 93 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0978  hypothetical protein  37.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>