50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1367 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  100 
 
 		 88 aa  183  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  90.8 
 
 		 88 aa  170  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  34.67 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  32.43 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  32.43 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  34.67 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  32.95 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  31.65 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  30.67 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  28.21 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  30.67 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2021  putative selenoprotein  31.17 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0964  conserved hypothetical selenoprotein  30.86 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1983  conserved hypothetical selenoprotein  32.88 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  36.62 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2298  hypothetical protein  29.87 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.928945  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  31.17 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1676  putative selenoprotein  32 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  31.58 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32780  SelT/selW/selH selenoprotein  32.05 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0978  hypothetical protein  33.75 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1037  hypothetical protein  33.75 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2834  putative selenoprotein  27.27 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  29.87 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20880  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1342  putative selenoprotein  32.5 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0645391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3358  hypothetical protein  26.67 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.652713  normal  0.0967165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  30.49 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3802  putative selenoprotein  29.11 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522888  hitchhiker  0.000000204216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4513  hypothetical protein  29.11 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2959  hypothetical protein  28.95 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004141  selenoprotein W-related protein  30.14 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1792  hypothetical protein  30.26 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1798  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  30.14 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01323  hypothetical protein  28.77 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1472  SelT/selW/selH selenoprotein  27.27 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.470177  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2622  SelT/selW/selH selenoprotein  30.38 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.712943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2187  SelT/SelW/SelH selenoprotein  35.85 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3596  selenoprotein W-related  25.97 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.780688  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4019  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0503  hypothetical protein  28.38 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  27.27 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1817  putative selenoprotein  25.97 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.702891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1398  hypothetical protein  27.27 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0987183  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4026  hypothetical protein  29.49 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2106  hypothetical protein  26.44 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.282136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  24.36 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0529  hypothetical protein  28.57 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>