16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2187 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2187  SelT/SelW/SelH selenoprotein  100 
 
 		 63 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  45.28 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  35.85 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  39.62 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  34.78 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1676  putative selenoprotein  35.71 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0964  conserved hypothetical selenoprotein  32.61 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  41.3 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0529  hypothetical protein  42 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  32.08 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  32.08 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  32.61 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  35.85 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>