27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2801 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2408  conserved hypothetical selenoprotein  52.7 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.72928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4026  hypothetical protein  48.48 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  43.06 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3449  conserved hypothetical selenoprotein  40.79 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  38.03 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  37.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  36.11 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  31.17 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  34.72 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  43.4 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  32.79 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  25.64 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  24.36 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  31.08 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1983  conserved hypothetical selenoprotein  32.79 
 
 
104 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  35.59 
 
 
108 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0529  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3596  selenoprotein W-related  31.67 
 
 
100 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.780688  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1792  hypothetical protein  31.34 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32780  SelT/selW/selH selenoprotein  31.03 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  27.78 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3358  hypothetical protein  30.38 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.652713  normal  0.0967165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1798  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2021  putative selenoprotein  28.57 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.796791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>