40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2408 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2408  conserved hypothetical selenoprotein  100 
 
 		 80 aa  157  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.72928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  52.7 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4026  hypothetical protein  46.97 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3449  conserved hypothetical selenoprotein  48.1 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  40.28 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  37.29 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  39.34 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  35.59 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  32.2 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  35.59 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2021  putative selenoprotein  37.29 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  32.2 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2622  SelT/selW/selH selenoprotein  35.48 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.712943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0978  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1037  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  37.29 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1983  conserved hypothetical selenoprotein  35.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  30.51 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2298  hypothetical protein  35.59 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.928945  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1342  putative selenoprotein  36.51 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0645391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32780  SelT/selW/selH selenoprotein  34.48 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  28.81 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  34.43 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  36.67 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1676  putative selenoprotein  28.81 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0964  conserved hypothetical selenoprotein  28.81 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3596  selenoprotein W-related  30.36 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.780688  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2834  putative selenoprotein  27.85 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1792  hypothetical protein  31.03 
 
 		 96 aa  40.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  28.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004141  selenoprotein W-related protein  27.59 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1472  SelT/selW/selH selenoprotein  29.31 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.470177  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1817  putative selenoprotein  32.76 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.702891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0503  hypothetical protein  30.51 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20880  hypothetical protein  32.76 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4077  hypothetical protein  31.03 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258277  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3358  hypothetical protein  29.82 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.652713  normal  0.0967165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>