21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3449 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3449  conserved hypothetical selenoprotein  100 
 
 		 101 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2408  conserved hypothetical selenoprotein  48.1 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.72928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4026  hypothetical protein  42.31 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  40.79 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  36.67 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  38.18 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  43.14 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  39.66 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  30.91 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  33.9 
 
 		 92 aa  43.9  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  32.73 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  30.91 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1342  putative selenoprotein  36.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0645391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  35.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2622  SelT/selW/selH selenoprotein  34.48 
 
 		 90 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.712943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  30.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0978  hypothetical protein  34.69 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  30.91 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1037  hypothetical protein  34.69 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>