58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1092 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  100 
 
 
93 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  68.82 
 
 
103 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  64.77 
 
 
95 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  60 
 
 
92 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  56.52 
 
 
94 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  56.82 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1817  putative selenoprotein  60.92 
 
 
93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.702891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32780  SelT/selW/selH selenoprotein  56.32 
 
 
98 aa  113  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1983  conserved hypothetical selenoprotein  54.02 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4019  hypothetical protein  57.47 
 
 
93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2021  putative selenoprotein  52.22 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4077  hypothetical protein  54.35 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258277  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4513  hypothetical protein  56.32 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20880  hypothetical protein  55.56 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1792  hypothetical protein  54.44 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2298  hypothetical protein  52.22 
 
 
104 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.928945  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  59.55 
 
 
107 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1342  putative selenoprotein  56.84 
 
 
99 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0645391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1472  SelT/selW/selH selenoprotein  56.32 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.470177  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  57.47 
 
 
97 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3802  putative selenoprotein  56.32 
 
 
93 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522888  hitchhiker  0.000000204216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0503  hypothetical protein  55.17 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0978  hypothetical protein  56.52 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  54.02 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1037  hypothetical protein  56.52 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  54.65 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3596  selenoprotein W-related  54.02 
 
 
100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.780688  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  52.87 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1398  hypothetical protein  55.17 
 
 
93 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0987183  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2106  hypothetical protein  54.95 
 
 
100 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.282136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1798  hypothetical protein  52.27 
 
 
100 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  56.32 
 
 
93 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  52.22 
 
 
95 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004141  selenoprotein W-related protein  52.87 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  54.02 
 
 
97 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3358  hypothetical protein  52.81 
 
 
106 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.652713  normal  0.0967165 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01323  hypothetical protein  52.87 
 
 
92 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2834  putative selenoprotein  50 
 
 
113 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  53.93 
 
 
93 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2959  hypothetical protein  52.75 
 
 
93 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0964  conserved hypothetical selenoprotein  49.43 
 
 
97 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1676  putative selenoprotein  50 
 
 
102 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2622  SelT/selW/selH selenoprotein  48.31 
 
 
90 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.712943  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02741  selenoprotein domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05220)  43.1 
 
 
195 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0721276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  50 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05460  Selenoprotein W, putative  41.49 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000763339  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34957  predicted protein  38.46 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0571  putative selenoprotein  31.58 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0529  hypothetical protein  35.53 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2408  conserved hypothetical selenoprotein  37.29 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.72928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4026  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  31.17 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28093  predicted protein  35.44 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  27.27 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  27.27 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2187  SelT/SelW/SelH selenoprotein  41.3 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0303  hypothetical protein  35.19 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>