30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0529 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  41.56 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  40.79 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  35.53 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  31.58 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  35.21 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0503  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004141  selenoprotein W-related protein  33.87 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4077  hypothetical protein  33.77 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258277  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01323  hypothetical protein  32.81 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  32.89 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  32 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0964  conserved hypothetical selenoprotein  33.9 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  30.99 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  28.4 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0303  hypothetical protein  41.94 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  30.99 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  40 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1676  putative selenoprotein  32.2 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2834  putative selenoprotein  30.51 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2959  hypothetical protein  31.17 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  31.58 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2187  SelT/SelW/SelH selenoprotein  42 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  29.58 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  28.57 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2106  hypothetical protein  30.56 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.282136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>