51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01323 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01323  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  193  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004141  selenoprotein W-related protein  94.57 
 
 		 92 aa  186  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0503  hypothetical protein  85.56 
 
 		 97 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1817  putative selenoprotein  67.05 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.702891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3802  putative selenoprotein  65.17 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522888  hitchhiker  0.000000204216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1792  hypothetical protein  65.91 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4019  hypothetical protein  65.91 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4513  hypothetical protein  64.77 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32780  SelT/selW/selH selenoprotein  64.77 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4249  conserved hypothetical selenoprotein  64.04 
 
 		 97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1798  hypothetical protein  62.92 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1398  hypothetical protein  61.8 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0987183  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3596  selenoprotein W-related  62.92 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.780688  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4514  hypothetical protein  62.92 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0655074  decreased coverage  0.00707025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1472  SelT/selW/selH selenoprotein  65.91 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.470177  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20880  hypothetical protein  62.5 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3399  putative selenoprotein  61.96 
 
 		 93 aa  123  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0011316  normal  0.572416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0112  hypothetical protein  60.67 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3465  putative selenoprotein  60.67 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0978  hypothetical protein  62.22 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1037  hypothetical protein  62.22 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3191  putative selenoprotein  59.77 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1342  putative selenoprotein  62.22 
 
 		 99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0645391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2466  putative selenoprotein  59.55 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0202  hypothetical protein  56.32 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0369961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0964  conserved hypothetical selenoprotein  54.55 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1676  putative selenoprotein  54.55 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2834  putative selenoprotein  55.29 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2021  putative selenoprotein  57.65 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2298  hypothetical protein  57.65 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.928945  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1983  conserved hypothetical selenoprotein  57.83 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2622  SelT/selW/selH selenoprotein  58.14 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.712943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2179  putative selenoprotein  55.29 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0839  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0384  SelT/selW/selH selenoprotein  56.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000942621  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1092  SelT/selW/selH selenoprotein  52.87 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2795  SelT/selW/selH selenoprotein  56.18 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.349899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3358  hypothetical protein  51.14 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.652713  normal  0.0967165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2959  hypothetical protein  48.31 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02741  selenoprotein domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05220)  42.98 
 
 		 195 aa  97.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0721276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4077  hypothetical protein  48.35 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258277  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1226  hypothetical protein  47.13 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2106  hypothetical protein  48.31 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.282136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2711  hypothetical protein  44.71 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874862  normal  0.300318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2265  putative selenoprotein  43.53 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0522176  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05460  Selenoprotein W, putative  40 
 
 		 219 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000763339  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34957  predicted protein  38.14 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28093  predicted protein  31.82 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0529  hypothetical protein  32.81 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1367  putative selenoprotein  28.77 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3574  putative selenoprotein  26.03 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261066  normal  0.235563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>