32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1832 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  930    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  99.14 
 
 
467 aa  923    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  96.15 
 
 
466 aa  871    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  47.84 
 
 
473 aa  438  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  40.65 
 
 
455 aa  312  9e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  38.96 
 
 
459 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  37.96 
 
 
476 aa  276  5e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  38.29 
 
 
454 aa  273  7e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  34.88 
 
 
489 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  36.14 
 
 
466 aa  193  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  37.99 
 
 
465 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  33.68 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  33.68 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  33.68 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  40.98 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  25.29 
 
 
423 aa  97.1  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  29.91 
 
 
422 aa  93.2  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  27.41 
 
 
417 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  37.5 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  33.67 
 
 
152 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  24.48 
 
 
191 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  35.45 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  32.73 
 
 
158 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  31.07 
 
 
153 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  32.48 
 
 
157 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  29.91 
 
 
177 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  30.3 
 
 
145 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  53.33 
 
 
133 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  35.87 
 
 
151 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  35.87 
 
 
151 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>