158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1308 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 		 371 aa  749    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.23 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.53 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.28 
 
 		 474 aa  260  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.34 
 
 		 416 aa  245  8e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  42.06 
 
 		 500 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.42 
 
 		 493 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  37.86 
 
 		 502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  37.27 
 
 		 436 aa  232  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.66 
 
 		 475 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.17 
 
 		 473 aa  229  6e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  38.72 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.89 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.5 
 
 		 484 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.11 
 
 		 484 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.24 
 
 		 484 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.95 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.17 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  35.03 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 		 485 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.25 
 
 		 484 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.99 
 
 		 484 aa  195  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.59 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.97 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.14 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.97 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.29 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.28 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.67 
 
 		 484 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  31.36 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.62 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.96 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.71 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.79 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 484 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.62 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  31.62 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.07 
 
 		 484 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.07 
 
 		 484 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.73 
 
 		 482 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.46 
 
 		 484 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.73 
 
 		 482 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.73 
 
 		 482 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.73 
 
 		 482 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.73 
 
 		 482 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.24 
 
 		 484 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  33.52 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.2 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.24 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.03 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.24 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.59 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  34.56 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.04 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.04 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.04 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.04 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  32.98 
 
 		 404 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.33 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.07 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.05 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.77 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 483 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 483 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 483 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.39 
 
 		 484 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  35.97 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.73 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.78 
 
 		 482 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.35 
 
 		 482 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.79 
 
 		 482 aa  176  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.28 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.24 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.7 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.48 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.79 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 482 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  35.06 
 
 		 309 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.61 
 
 		 496 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.28 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  31.56 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.33 
 
 		 414 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  30.57 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.12 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.05 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.96 
 
 		 385 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.41 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.98 
 
 		 422 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.13 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>