More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3548 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.12 
 
 		 177 aa  260  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.94 
 
 		 174 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.97 
 
 		 174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  67.28 
 
 		 174 aa  242  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.71 
 
 		 174 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.24 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  42.42 
 
 		 178 aa  164  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  40.74 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  43.24 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  36.9 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  35.76 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.84 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  31.67 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  31.67 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  33.97 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  35.19 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  34.57 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  32.05 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  27.95 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  34.57 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  34.57 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  33.95 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.95 
 
 		 166 aa  94.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  27.04 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  32.48 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  30.57 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  31.16 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  27.67 
 
 		 223 aa  87.8  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.95 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  36.7 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.49 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  21.59 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  25.49 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.77 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  25.5 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  28.3 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.82 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  29.25 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.95 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  26.56 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  25.5 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  30.69 
 
 		 105 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  23.01 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  30.63 
 
 		 109 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  29.85 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  25.42 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  28.22 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  28.18 
 
 		 105 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  26.72 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  26.39 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  30.21 
 
 		 107 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.83 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  29 
 
 		 100 aa  51.6  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.16 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.14 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  30 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 		 206 aa  50.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.76 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  32 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  30.16 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  29.27 
 
 		 636 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  27.62 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.83 
 
 		 105 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  29 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  24.83 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  27.97 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.02 
 
 		 446 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  27.36 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.2 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  29.09 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  27.27 
 
 		 104 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  27.78 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  29.03 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  25.51 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  28.16 
 
 		 107 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  24.76 
 
 		 403 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  24.76 
 
 		 403 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.86 
 
 		 409 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  26.52 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  29.1 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  28.07 
 
 		 110 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  32.93 
 
 		 107 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  27.37 
 
 		 107 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  26.96 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  28.04 
 
 		 107 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  28.28 
 
 		 106 aa  48.5  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.46 
 
 		 102 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  28.04 
 
 		 107 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>