More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2724 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2724  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.497191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2527  ABC transporter, ATP-binding protein  63.83 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  47.06 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  44.39 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  46.82 
 
 		 247 aa  193  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  45.33 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  44.7 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  44.05 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.24 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  46.36 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  45.87 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  45.41 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  47.22 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  44.8 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  45.21 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  46.26 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  45.41 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 253 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.91 
 
 		 249 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  45.91 
 
 		 249 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.91 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  43.89 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  46.79 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  45.45 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  43.32 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  43.78 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  44.4 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  45.16 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  44.4 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  44.4 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  44.4 
 
 		 246 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  43.89 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  43.89 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  41.1 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  43.84 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  40.91 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  43.84 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  44.09 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  42.2 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  42.73 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  42.98 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  42.92 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.06 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  42.11 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  42.11 
 
 		 260 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  43.19 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  40.91 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  43.32 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  44.06 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  40.19 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  44.19 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  41.89 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  44.86 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  42.15 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  43.32 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  44.8 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.12 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  44.75 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  41.51 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  43.72 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.64 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  43.05 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.17 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  41.67 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  42.66 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  42.01 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>