More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2096 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  47.44 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  45.74 
 
 		 243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  45.07 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  45.41 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  48.69 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  41.2 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  45.54 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.01 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  46.26 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  45.62 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 		 284 aa  175  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  44.61 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  42.03 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  41.67 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  38.68 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  43.58 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.91 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.36 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.57 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.21 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 		 254 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.57 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  38.07 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  38.07 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  38.07 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0554  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  36.19 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 453 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  39.44 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  38.36 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 242 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.64 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  37.68 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  39.81 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.1 
 
 		 440 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.32 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  35.21 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.9 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.57 
 
 		 281 aa  145  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.5 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 		 541 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.2 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.56 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  35.62 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  33.33 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.72 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.74 
 
 		 810 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  35.94 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  35.94 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 		 395 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  35.85 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 274 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  36.23 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  36.79 
 
 		 254 aa  138  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.27 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 		 244 aa  137  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  36.06 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.4 
 
 		 403 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  36.57 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  37 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.49 
 
 		 398 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.34 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 279 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1130  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.18 
 
 		 279 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.25 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  34.23 
 
 		 248 aa  134  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 		 276 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>