66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0765 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  85.62 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  87.58 
 
 		 154 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  87.58 
 
 		 154 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  87.58 
 
 		 154 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  86.93 
 
 		 154 aa  277  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  87.58 
 
 		 154 aa  277  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  87.58 
 
 		 154 aa  277  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  88.24 
 
 		 204 aa  277  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  87.01 
 
 		 154 aa  277  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  85.06 
 
 		 154 aa  274  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  86.93 
 
 		 154 aa  273  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  77.78 
 
 		 154 aa  250  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  76.47 
 
 		 155 aa  244  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  75.82 
 
 		 155 aa  235  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  67.32 
 
 		 153 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  67.32 
 
 		 153 aa  224  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  66.01 
 
 		 153 aa  223  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  65.36 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  61.44 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  63.4 
 
 		 154 aa  197  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  58.17 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  45.7 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  42.86 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  42.31 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  40.4 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  36.6 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  40 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  33.33 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  30.57 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.87 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.87 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  28.46 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  26.76 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.45 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  30.4 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.23 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.23 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  24.18 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  25.69 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  31.63 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  26.77 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  28.19 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  28.91 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  24.05 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  24.79 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  27.14 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  24.84 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  28.44 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  26.77 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  26.43 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  22.86 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  27.04 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  23.4 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  25.95 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  32.29 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  22.88 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  25.33 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  32 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  29.59 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  26.32 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  26.62 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  30.95 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.09 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  21.74 
 
 		 300 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>