More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0668 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  100 
 
 		 387 aa  757    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  85.9 
 
 		 395 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  80.42 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.25 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  43.21 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  42.24 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  43.18 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  42.05 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  37.63 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  41.74 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  42.02 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 396 aa  245  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 393 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  38.27 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  38.01 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  39.27 
 
 		 391 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  40 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  36.81 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  37.98 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  39.71 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  39.27 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  40 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  39.71 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  37.47 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  41.23 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  40.95 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  40.95 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  40.95 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  40.95 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>