45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0178 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  41.31 
 
 		 858 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.46 
 
 		 852 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.58 
 
 		 848 aa  1221    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  60.54 
 
 		 850 aa  1056    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.2 
 
 		 831 aa  908    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 848 aa  1741    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  63.18 
 
 		 845 aa  1107    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  38.17 
 
 		 885 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  37.35 
 
 		 836 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.91 
 
 		 862 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.56 
 
 		 863 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 871 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.6 
 
 		 860 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.67 
 
 		 837 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 834 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  29.04 
 
 		 823 aa  340  7e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  26.76 
 
 		 816 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.25 
 
 		 829 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.06 
 
 		 911 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  25 
 
 		 887 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1057 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.8 
 
 		 840 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.25 
 
 		 874 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  21.65 
 
 		 906 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  27.31 
 
 		 923 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  25 
 
 		 983 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  26.09 
 
 		 931 aa  74.3  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  23.87 
 
 		 932 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.5 
 
 		 923 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.52 
 
 		 942 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.16 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.84 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.84 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.59 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.67 
 
 		 526 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  28.73 
 
 		 452 aa  54.7  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.35 
 
 		 609 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  34.07 
 
 		 425 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  26.36 
 
 		 392 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.97 
 
 		 557 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.34 
 
 		 631 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.12 
 
 		 506 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.29 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.98 
 
 		 615 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  23.87 
 
 		 490 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>