More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9385 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  100 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  75.59 
 
 		 226 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  67.51 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  57.4 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  57.42 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  59.2 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  57.3 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  52.23 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  50.64 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  52.4 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  49.57 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  47.26 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  50.23 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  51.2 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  49.77 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  51.61 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  58.71 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  48.74 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  46.61 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  52.09 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  49.5 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  49.5 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  48.71 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  46.04 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  48.22 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  60.87 
 
 		 236 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  48.51 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  52.02 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  49.05 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  53.01 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  47.32 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  53.49 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  47.57 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  48.04 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  41.12 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  32.98 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  44.59 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.52 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  45.65 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  45.16 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  35.04 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  31.75 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.6 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  40.91 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.98 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  37.97 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  35.12 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  36.5 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  38.31 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  42.65 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  42.66 
 
 		 205 aa  92.4  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  36.71 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  35.92 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  38.52 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  33.99 
 
 		 207 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  31.79 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  37.88 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  37.18 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  39.73 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  40.14 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  40.82 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.54 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  34.23 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  38.26 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6890  methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  38.26 
 
 		 211 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  40.94 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  34.23 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  34.23 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  34.23 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  34.23 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  39.43 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>