49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7104 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  45.12 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  46.2 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  31.33 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  32.53 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  32 
 
 		 398 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  28.49 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  30.98 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  30.59 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  31.56 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  29 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  30.75 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  29.53 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  32.73 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  32.22 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  31.21 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  29.43 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  29.61 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  28.1 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  29.63 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  32.33 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  30.28 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  30.77 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  31.07 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  30.31 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  29.13 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.43 
 
 		 752 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  30.28 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  32.72 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  30.5 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  28.05 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  28.61 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  26.33 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  28.52 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  30.12 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  22.88 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  24.24 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.61 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  24.7 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  26.59 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  24.72 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  27.27 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  25.36 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  27.92 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1646  hypothetical protein  23.58 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000452381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  24.92 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  30.6 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  24.78 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  24.78 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>