38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6522 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  68.29 
 
 		 369 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  63.96 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  58.55 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  54.14 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  50.97 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  51.58 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  44.01 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  40.61 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  40.61 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  40.61 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  39.86 
 
 		 306 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  39.31 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  38.1 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  30.38 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  31.75 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  28.17 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  33.69 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  28.91 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  22.08 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  25.29 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  22.37 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  20.37 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  34.29 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  25.39 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1906  hypothetical protein  25.98 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  27.54 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  24.74 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  22.4 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  22.98 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  25.2 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>