45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5427 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  63.92 
 
 
199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  32.79 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  29.41 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  32.11 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  34.13 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  30.53 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.98 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  23.76 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.22 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  29.94 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  29.73 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  29.94 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  29.94 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  27.59 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  31.05 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  25.54 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  29.31 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  27.27 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  31.37 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  29.1 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  29.1 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  31.21 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  32.33 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.47 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
437 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  30.2 
 
 
220 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  26.29 
 
 
183 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  28 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  30.93 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  30.2 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  24.1 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  26.38 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1000  hypothetical protein  30.71 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  26.29 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.01 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  27.13 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  28.09 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  25.2 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  27.35 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  29.85 
 
 
198 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  44.74 
 
 
234 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  32.16 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  26.76 
 
 
198 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>