More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1285 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  71.55 
 
 		 460 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  73.52 
 
 		 460 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  85.96 
 
 		 463 aa  781    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 464 aa  924    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  70.39 
 
 		 481 aa  628  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  64.5 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  63.12 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  65.87 
 
 		 465 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  63.27 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  63.54 
 
 		 467 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 		 467 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  64.68 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  60.47 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  62.5 
 
 		 491 aa  531  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  64.18 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.64 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.98 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  61.06 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  60.73 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  59.78 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  60.73 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  60.43 
 
 		 495 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  58.89 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  60.73 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  59.57 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  60.64 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  62.19 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  59.4 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  58.42 
 
 		 476 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  60.17 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  55.91 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.28 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  60.04 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  56.44 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  60.22 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.33 
 
 		 470 aa  262  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.6 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.86 
 
 		 562 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.21 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.99 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.98 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  33.77 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.07 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 480 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  32.68 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 467 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.67 
 
 		 465 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 		 468 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.99 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.06 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.34 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.25 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.98 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.25 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.03 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 		 477 aa  223  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.54 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.18 
 
 		 473 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 465 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.46 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.89 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.37 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.88 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>