88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1153 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  68.23 
 
 
201 aa  255  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  52.11 
 
 
224 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  54.17 
 
 
187 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  49.47 
 
 
191 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  45.45 
 
 
197 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  45.7 
 
 
188 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  47.85 
 
 
201 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  43.7 
 
 
142 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  36.41 
 
 
184 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  35.14 
 
 
184 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  37.78 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  34 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  28.42 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  31.67 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  37.31 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  32.9 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  32.68 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  36.81 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  40.17 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  35.77 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  32.67 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  32.65 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  32.65 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  30.64 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.15 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  26.28 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  26.28 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  33.58 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  31.08 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  26.15 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  27.08 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  32.33 
 
 
210 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  31.03 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  28.93 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  28.99 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.37 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  29.05 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  27.89 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  25.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  28.9 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  30.82 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  29.68 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  32.62 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  24.57 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  24.57 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  29.13 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  29.13 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  27.35 
 
 
180 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  27.15 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 
186 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  32 
 
 
200 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  41.25 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  28.14 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  29.13 
 
 
188 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  29.71 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  28.95 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
187 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  28.47 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  30.71 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  26.71 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  32 
 
 
193 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  24.14 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  28.91 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  30.89 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  28.08 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  30.86 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  28.38 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  26.02 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  26.75 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
183 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  27.91 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.55 
 
 
204 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  23.77 
 
 
181 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  23.77 
 
 
181 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
186 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  26.13 
 
 
186 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>