128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0217 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  56.59 
 
 		 188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  55.38 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  49.14 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  41.4 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  42.13 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  42.31 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  40.11 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  41.21 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  38.12 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  38.64 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  38.65 
 
 		 162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  42.36 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  37.1 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  40.74 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  40.74 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  42 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  37.91 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  37.43 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  38.67 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  36.69 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  36.26 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  38.17 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  37.68 
 
 		 170 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  37.11 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  32.95 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  37.72 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  32.77 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  32.77 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  39.86 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  35.44 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  38.46 
 
 		 210 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  31.69 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  29.8 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  31.93 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  33.52 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.32 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  34 
 
 		 117 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  25.79 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  26.16 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  34.43 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  32.04 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  22.4 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.43 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  26.99 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  28.49 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.39 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  26.21 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  28.25 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  29.67 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  21.08 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  25.99 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  27.6 
 
 		 251 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  31.45 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25.15 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  36.3 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  35.83 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  29.12 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  28.49 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  28.27 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1492  hypothetical protein  28.02 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  28.92 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  31.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  24.71 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.24 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  30.36 
 
 		 126 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  25.14 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  27.95 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  31.01 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  35 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4541  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  26.29 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  24.28 
 
 		 244 aa  45.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  28.48 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  23.26 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  24.56 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3650  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  25.67 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3704  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484496  normal  0.24289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  31.71 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  25.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>