83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3996 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  55.38 
 
 
186 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  48.66 
 
 
189 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  47.28 
 
 
188 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  46.49 
 
 
187 aa  168  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  45.65 
 
 
189 aa  167  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  44.62 
 
 
187 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  36.96 
 
 
186 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  42.7 
 
 
185 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  35.87 
 
 
186 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  49.25 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  38.65 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  47.41 
 
 
189 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  45.19 
 
 
200 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  45.19 
 
 
200 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  40.46 
 
 
179 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  39.05 
 
 
193 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  37.37 
 
 
195 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  44.44 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  40.68 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  37.02 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  34.95 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  36.52 
 
 
180 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  40.4 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  37.08 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  37.7 
 
 
196 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  37.08 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  34.41 
 
 
186 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
190 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
182 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
182 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  34.07 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  39.16 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  36.05 
 
 
170 aa  94.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  33.54 
 
 
190 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  36.23 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  36.23 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  32.81 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  32.19 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  35.35 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  34.67 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  31.02 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  28.96 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  30.22 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  23.96 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  31.03 
 
 
197 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  28.96 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  27.03 
 
 
208 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  24.34 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.67 
 
 
200 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  29.76 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  28.38 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  29.77 
 
 
203 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  25.89 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  22.56 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  25.15 
 
 
193 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4621  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  36.89 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2064  hypothetical protein  38.57 
 
 
81 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  31.33 
 
 
188 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  23.53 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  30.63 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  31.91 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  24.87 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
126 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
142 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  23.66 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  32.85 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  21.69 
 
 
251 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  26.88 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  30.25 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  29.79 
 
 
224 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.61 
 
 
204 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  23.5 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  39.29 
 
 
213 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
195 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>