46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7645 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  30.3 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  34.88 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  35.85 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  33.6 
 
 
253 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  32.28 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  32.81 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  32.28 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  31.03 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  33.77 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  34.91 
 
 
191 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  32.34 
 
 
224 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  31.54 
 
 
184 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  33.63 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  28.87 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  32.03 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  27.69 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  31.29 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  34.81 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  30.33 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.97 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  28.31 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  30.28 
 
 
187 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  40.17 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  29.23 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  31.2 
 
 
201 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  30.89 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  28.95 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  32.11 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  29.82 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  32.29 
 
 
142 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  37.69 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.37 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  29.31 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  27.83 
 
 
198 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  27.39 
 
 
225 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  32.48 
 
 
214 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  29.69 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  30.97 
 
 
197 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  28.91 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  24.22 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  27.16 
 
 
218 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  26.17 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  31.11 
 
 
182 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>