105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3548 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  56.59 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  50.29 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  47.28 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  46.51 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  44.44 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  45.09 
 
 		 189 aa  151  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  40.22 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  40.91 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  37.43 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  39.26 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  41.81 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  41.29 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  41.62 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  44.44 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  38.93 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  38.93 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  38.3 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  35.23 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  37.08 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  42.76 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  38.71 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  39.33 
 
 		 202 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  43.8 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  38.92 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  34.23 
 
 		 170 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  40.38 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  36.76 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  29.57 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  35.95 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  34.84 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  33.55 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  37.1 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  33.55 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  30.72 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  37.84 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  36.81 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  36.08 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  28.88 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  28.88 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  29.48 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  31.1 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  28.88 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  33.75 
 
 		 117 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  28.19 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  24.12 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  24.28 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.38 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  33.87 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  23.26 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  24.03 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  33.09 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  27.47 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  32.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.38 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  33.6 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  27.63 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  30.25 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  27.67 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  34.31 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  31.61 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  30.11 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  25.17 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  29.14 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  26.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  24.81 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1492  hypothetical protein  25.56 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  34.01 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  33.09 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  26.28 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  23.49 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  26.06 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  23.78 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  32.12 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  27.85 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  26.97 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  24.69 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.66 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  34.62 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  26.03 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  31.65 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  26.34 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  28.38 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  24.4 
 
 		 203 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 		 226 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  24.5 
 
 		 242 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>