90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2159 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  85.95 
 
 
186 aa  322  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  77.84 
 
 
185 aa  284  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  39.06 
 
 
195 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  39.04 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  42.86 
 
 
187 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  36.98 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  40.11 
 
 
202 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
200 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
200 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  35.68 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  41.3 
 
 
189 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  34.76 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  41.11 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  37.23 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  34.81 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  38.34 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  38.71 
 
 
188 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  34.81 
 
 
186 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  42.13 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  36.11 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  32.46 
 
 
190 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  36.41 
 
 
196 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
186 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  36.26 
 
 
186 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  36.87 
 
 
180 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  41.48 
 
 
162 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  30.89 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 
179 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  34.08 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  95.5  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  39.46 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  35 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  30.11 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  41 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  28.42 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  38.52 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  28.76 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  44.14 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  35.71 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  34.68 
 
 
201 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  36.44 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  27.17 
 
 
257 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  34.53 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  30.09 
 
 
135 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  27.74 
 
 
183 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 
218 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  27.81 
 
 
242 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  33.1 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  28.27 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  26.37 
 
 
245 aa  48.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  28 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  29.95 
 
 
251 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  32.65 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  27.61 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  30.94 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  26.83 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  24.82 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  35.4 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  32.81 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.06 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  26.16 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  36.44 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  24.6 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  24.08 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.93 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  25.78 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  26.59 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  25.69 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  24.24 
 
 
223 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  32.86 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  38.27 
 
 
205 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.68 
 
 
203 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  28.12 
 
 
191 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  41.2  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>