56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2740 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  56.85 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1821  hypothetical protein  74.04 
 
 		 132 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.977434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  38.76 
 
 		 184 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  38.42 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  34.18 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  38.62 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  34.94 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  36.22 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  34.43 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  30.73 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  32.91 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  32.37 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  34.55 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  30.27 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  39.86 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  39.46 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  39.46 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  35.46 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  29.17 
 
 		 170 aa  86.3  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  32.14 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  35.95 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  32.89 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  36.08 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  39.36 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  29.86 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  32.62 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  30.69 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  30.83 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  30.72 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  25.64 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  25.83 
 
 		 135 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  35.25 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  34.26 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  26.04 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  35.48 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  34.17 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  31.18 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  24.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  24.67 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 		 126 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  33.58 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>