120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4399 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  61.67 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  34.52 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  35.53 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  31.46 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  34.36 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  31.29 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  33.13 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  30.49 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  29.48 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.77 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  30.16 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  30.67 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  24.83 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.99 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.69 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  24.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  28.1 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  26.51 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  24.69 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  28 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  31.85 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  26.98 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  22.86 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  28.26 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  26.15 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  23.78 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  31.45 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  27.41 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  23.86 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  26.72 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  25.95 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  25.81 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.3 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  22.29 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  29.93 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  22.48 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  33.07 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  26.76 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  23.4 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  27.49 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  24.46 
 
 		 245 aa  48.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  20.57 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  24.86 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  41.18 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  48.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  21.43 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  29.37 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  32.31 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  32.88 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  25.79 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  25.44 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  34.68 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  22.62 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  21.92 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25.62 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  30.06 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  26.01 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  21.37 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  29.23 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  26.01 
 
 		 254 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  32.53 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  23.7 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  27.61 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  32.81 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  21.58 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  25.27 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  25.34 
 
 		 257 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  22.5 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  33.09 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  25.95 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  29.59 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  25.71 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  31.43 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  23.3 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  28.24 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  28.85 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5071  protein of unknown function DUF820  27.21 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  20.39 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  31.45 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  26.12 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>