More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0588 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  78.7 
 
 
231 aa  374  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  74.07 
 
 
240 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  68.87 
 
 
239 aa  317  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  66.51 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.42 
 
 
294 aa  308  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  66.19 
 
 
319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.74 
 
 
302 aa  304  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.75 
 
 
269 aa  291  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  62.39 
 
 
283 aa  290  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  62.1 
 
 
252 aa  285  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  62.19 
 
 
263 aa  275  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  59.43 
 
 
269 aa  267  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  58.18 
 
 
294 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  58.18 
 
 
294 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.16 
 
 
228 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  57.27 
 
 
294 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  56.68 
 
 
287 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  56.02 
 
 
253 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  56.76 
 
 
230 aa  244  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  53.33 
 
 
262 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.22 
 
 
706 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  54.63 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  53.52 
 
 
273 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  53.7 
 
 
317 aa  227  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.71 
 
 
237 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  52.29 
 
 
341 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  50.22 
 
 
253 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  51.85 
 
 
254 aa  211  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  51.89 
 
 
249 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
208 aa  138  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  40.25 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.97 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.4 
 
 
160 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
165 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.11 
 
 
162 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  37.14 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.91 
 
 
230 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.11 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  35.81 
 
 
166 aa  112  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.1 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.9 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.19 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.71 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.53 
 
 
188 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.31 
 
 
270 aa  108  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.51 
 
 
165 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
163 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
176 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.22 
 
 
175 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.48 
 
 
161 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.97 
 
 
160 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  36.49 
 
 
172 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.13 
 
 
176 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38 
 
 
175 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.75 
 
 
166 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.41 
 
 
170 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.24 
 
 
162 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  35.14 
 
 
173 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  35.46 
 
 
173 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  38.55 
 
 
167 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.88 
 
 
222 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.55 
 
 
212 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  37.67 
 
 
158 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  38.55 
 
 
167 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.57 
 
 
171 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.4 
 
 
208 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
165 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  42.64 
 
 
167 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 
249 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0147  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.05 
 
 
174 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.73 
 
 
163 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.73 
 
 
163 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.19 
 
 
168 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.19 
 
 
163 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0108  hypothetical protein  35.57 
 
 
377 aa  101  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.996331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36 
 
 
165 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
171 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
171 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
171 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.25 
 
 
151 aa  101  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
224 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  36.48 
 
 
217 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3599  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.69 
 
 
158 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  32.9 
 
 
159 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.76 
 
 
163 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  39.55 
 
 
159 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.76 
 
 
163 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4240  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.87 
 
 
168 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.33 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.62 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.945573 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.08 
 
 
169 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.42 
 
 
157 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.42 
 
 
157 aa  99.4  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  36.88 
 
 
157 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.98 
 
 
162 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.12 
 
 
385 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.59 
 
 
160 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_634  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  32.45 
 
 
157 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.34 
 
 
177 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>